MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid pBClin15

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004721	CAT	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899112
2	NC_004721	GAAC	2	8	414	421	50 %	0 %	25 %	25 %	29899112
3	NC_004721	AAG	2	6	425	430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899112
4	NC_004721	TTA	2	6	508	513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899112
5	NC_004721	GGA	2	6	525	530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899112
6	NC_004721	TAAA	2	8	599	606	75 %	25 %	0 %	0 %	29899113
7	NC_004721	GCA	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899113
8	NC_004721	TTC	2	6	673	678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29899113
9	NC_004721	AGA	2	6	813	818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899113
10	NC_004721	ATT	2	6	925	930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899113
11	NC_004721	TTACAA	2	12	1018	1029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	29899113
12	NC_004721	T	6	6	1080	1085	0 %	100 %	0 %	0 %	29899114
13	NC_004721	A	7	7	1086	1092	100 %	0 %	0 %	0 %	29899114
14	NC_004721	TGT	2	6	1100	1105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29899114
15	NC_004721	AGA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899114
16	NC_004721	CAT	2	6	1222	1227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899114
17	NC_004721	AGT	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899114
18	NC_004721	TAA	2	6	1395	1400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899115
19	NC_004721	AAGA	2	8	1407	1414	75 %	0 %	25 %	0 %	29899115
20	NC_004721	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899115
21	NC_004721	TAG	2	6	1461	1466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899115
22	NC_004721	CTA	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899115
23	NC_004721	A	6	6	1528	1533	100 %	0 %	0 %	0 %	29899115
24	NC_004721	GTT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29899115
25	NC_004721	TTA	2	6	1712	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899115
26	NC_004721	AAAGA	2	10	1728	1737	80 %	0 %	20 %	0 %	29899115
27	NC_004721	GGTT	2	8	1768	1775	0 %	50 %	50 %	0 %	29899115
28	NC_004721	GGT	2	6	1804	1809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899115
29	NC_004721	AGA	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899115
30	NC_004721	TCA	2	6	1848	1853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899115
31	NC_004721	ATG	2	6	1939	1944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899115
32	NC_004721	AGA	2	6	1962	1967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899115
33	NC_004721	GTTT	2	8	1977	1984	0 %	75 %	25 %	0 %	29899115
34	NC_004721	TA	3	6	2044	2049	50 %	50 %	0 %	0 %	29899115
35	NC_004721	AGA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899115
36	NC_004721	AAG	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
37	NC_004721	A	7	7	2118	2124	100 %	0 %	0 %	0 %	29899116
38	NC_004721	GTTT	2	8	2201	2208	0 %	75 %	25 %	0 %	29899116
39	NC_004721	ATT	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
40	NC_004721	ACT	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899116
41	NC_004721	GT	3	6	2356	2361	0 %	50 %	50 %	0 %	29899116
42	NC_004721	AATC	2	8	2369	2376	50 %	25 %	0 %	25 %	29899116
43	NC_004721	TAC	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899116
44	NC_004721	AAGA	2	8	2497	2504	75 %	0 %	25 %	0 %	29899116
45	NC_004721	TAA	2	6	2562	2567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899116
46	NC_004721	GAC	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899116
47	NC_004721	TCGT	2	8	2646	2653	0 %	50 %	25 %	25 %	29899116
48	NC_004721	TTCT	2	8	2663	2670	0 %	75 %	0 %	25 %	29899116
49	NC_004721	AGA	2	6	2823	2828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
50	NC_004721	TTA	2	6	2844	2849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
51	NC_004721	AGAAA	2	10	2985	2994	80 %	0 %	20 %	0 %	29899116
52	NC_004721	CGT	2	6	3010	3015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29899116
53	NC_004721	TAC	2	6	3077	3082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899116
54	NC_004721	ATT	2	6	3105	3110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
55	NC_004721	ACT	2	6	3153	3158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899116
56	NC_004721	AT	3	6	3225	3230	50 %	50 %	0 %	0 %	29899116
57	NC_004721	TTG	2	6	3242	3247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29899116
58	NC_004721	AGAGAA	2	12	3341	3352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
59	NC_004721	ACAT	2	8	3374	3381	50 %	25 %	0 %	25 %	29899116
60	NC_004721	AAC	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899116
61	NC_004721	TA	3	6	3533	3538	50 %	50 %	0 %	0 %	29899116
62	NC_004721	AAC	2	6	3551	3556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899116
63	NC_004721	ATG	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899116
64	NC_004721	GATA	2	8	3627	3634	50 %	25 %	25 %	0 %	29899116
65	NC_004721	AAG	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
66	NC_004721	AAG	2	6	3728	3733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
67	NC_004721	GAA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
68	NC_004721	GAAA	2	8	3863	3870	75 %	0 %	25 %	0 %	29899116
69	NC_004721	GAA	2	6	3921	3926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
70	NC_004721	AATT	2	8	3930	3937	50 %	50 %	0 %	0 %	29899116
71	NC_004721	TTA	2	6	3940	3945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
72	NC_004721	TAT	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
73	NC_004721	A	6	6	4015	4020	100 %	0 %	0 %	0 %	29899116
74	NC_004721	ATGAA	2	10	4022	4031	60 %	20 %	20 %	0 %	29899116
75	NC_004721	ATG	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899116
76	NC_004721	TAA	2	6	4103	4108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899116
77	NC_004721	TAT	2	6	4150	4155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
78	NC_004721	AAGT	2	8	4188	4195	50 %	25 %	25 %	0 %	29899116
79	NC_004721	AGA	2	6	4266	4271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
80	NC_004721	GTAT	2	8	4390	4397	25 %	50 %	25 %	0 %	29899117
81	NC_004721	CAT	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899117
82	NC_004721	AGTACC	2	12	5010	5021	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29899118
83	NC_004721	CAC	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29899118
84	NC_004721	GGA	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899118
85	NC_004721	GAC	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899118
86	NC_004721	GAG	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899118
87	NC_004721	AAG	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899118
88	NC_004721	A	6	6	5163	5168	100 %	0 %	0 %	0 %	29899118
89	NC_004721	A	6	6	5208	5213	100 %	0 %	0 %	0 %	29899118
90	NC_004721	GCA	2	6	5214	5219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899118
91	NC_004721	CAT	2	6	5233	5238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899118
92	NC_004721	AAATTA	2	12	5257	5268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899118
93	NC_004721	TGA	2	6	5333	5338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899118
94	NC_004721	A	6	6	5489	5494	100 %	0 %	0 %	0 %	29899118
95	NC_004721	AGG	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899118
96	NC_004721	TAG	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899118
97	NC_004721	AAC	2	6	5596	5601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899118
98	NC_004721	CCA	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29899118
99	NC_004721	TATC	2	8	5764	5771	25 %	50 %	0 %	25 %	29899119
100	NC_004721	TAT	2	6	5818	5823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899119
101	NC_004721	GAA	2	6	5825	5830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899119
102	NC_004721	TCC	2	6	5919	5924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29899119
103	NC_004721	GAA	2	6	6013	6018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899119
104	NC_004721	GACGTC	2	12	6123	6134	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	29899120
105	NC_004721	AGAA	2	8	6178	6185	75 %	0 %	25 %	0 %	29899120
106	NC_004721	TAG	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899120
107	NC_004721	CGT	2	6	6224	6229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29899120
108	NC_004721	ATC	2	6	6270	6275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899120
109	NC_004721	GAA	2	6	6291	6296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899120
110	NC_004721	TGA	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899120
111	NC_004721	GTA	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899120
112	NC_004721	AAG	2	6	6445	6450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899120
113	NC_004721	AC	3	6	6513	6518	50 %	0 %	0 %	50 %	29899120
114	NC_004721	T	6	6	6519	6524	0 %	100 %	0 %	0 %	29899120
115	NC_004721	GGATG	2	10	6633	6642	20 %	20 %	60 %	0 %	29899120
116	NC_004721	AGG	2	6	6671	6676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899120
117	NC_004721	GCA	2	6	7009	7014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899121
118	NC_004721	ATT	2	6	7024	7029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899121
119	NC_004721	CAA	2	6	7034	7039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899121
120	NC_004721	ATT	2	6	7123	7128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899121
121	NC_004721	TTA	2	6	7139	7144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899121
122	NC_004721	ACG	2	6	7222	7227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899121
123	NC_004721	AAT	2	6	7244	7249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899121
124	NC_004721	TAT	2	6	7320	7325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899121
125	NC_004721	TCT	2	6	7370	7375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29899121
126	NC_004721	AATT	2	8	7396	7403	50 %	50 %	0 %	0 %	29899121
127	NC_004721	A	6	6	7511	7516	100 %	0 %	0 %	0 %	29899121
128	NC_004721	TTAAA	2	10	7521	7530	60 %	40 %	0 %	0 %	29899121
129	NC_004721	AAT	2	6	7538	7543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899121
130	NC_004721	GGT	2	6	7673	7678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899121
131	NC_004721	AGA	2	6	7768	7773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899121
132	NC_004721	ATGT	2	8	7889	7896	25 %	50 %	25 %	0 %	29899121
133	NC_004721	GGT	2	6	7931	7936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899121
134	NC_004721	TCA	2	6	8102	8107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899122
135	NC_004721	ACCAGA	2	12	8162	8173	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	29899122
136	NC_004721	GTTATT	2	12	8280	8291	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29899122
137	NC_004721	GATG	2	8	8320	8327	25 %	25 %	50 %	0 %	29899123
138	NC_004721	ATG	2	6	8390	8395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899123
139	NC_004721	T	6	6	8594	8599	0 %	100 %	0 %	0 %	29899124
140	NC_004721	TGA	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899124
141	NC_004721	A	6	6	8649	8654	100 %	0 %	0 %	0 %	29899124
142	NC_004721	AGT	2	6	8738	8743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899124
143	NC_004721	A	6	6	8799	8804	100 %	0 %	0 %	0 %	29899124
144	NC_004721	GAT	2	6	8808	8813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899124
145	NC_004721	TA	3	6	8830	8835	50 %	50 %	0 %	0 %	29899124
146	NC_004721	AACAA	2	10	8856	8865	80 %	0 %	0 %	20 %	29899124
147	NC_004721	A	6	6	8907	8912	100 %	0 %	0 %	0 %	29899124
148	NC_004721	GGT	2	6	8980	8985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899124
149	NC_004721	ATG	2	6	9343	9348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899125
150	NC_004721	TA	3	6	9383	9388	50 %	50 %	0 %	0 %	29899125
151	NC_004721	TCA	2	6	9450	9455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899125
152	NC_004721	AATTT	2	10	9518	9527	40 %	60 %	0 %	0 %	29899125
153	NC_004721	AGG	2	6	9599	9604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899125
154	NC_004721	CTG	2	6	9629	9634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29899126
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156	NC_004721	A	6	6	9669	9674	100 %	0 %	0 %	0 %	29899126
157	NC_004721	TTTC	2	8	9717	9724	0 %	75 %	0 %	25 %	29899126
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161	NC_004721	TGA	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899126
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163	NC_004721	AAG	2	6	9860	9865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899126
164	NC_004721	GAT	2	6	9867	9872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899126
165	NC_004721	AGCG	2	8	9951	9958	25 %	0 %	50 %	25 %	29899126
166	NC_004721	CTA	2	6	10001	10006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899126
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169	NC_004721	TTA	2	6	10093	10098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899126
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172	NC_004721	TAT	2	6	10281	10286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899127
173	NC_004721	ATC	2	6	10308	10313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899127
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254	NC_004721	CAT	2	6	14862	14867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899132
255	NC_004721	AAG	2	6	14937	14942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899132
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258	NC_004721	CTG	2	6	15109	15114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29899132
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.